Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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