Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLK3P07288 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms