Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6BP04259 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6BP04259 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms