Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms