Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms