Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms