Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms