Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNJ1O43426 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ1O43426 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms