Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms