Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms