Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.143e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.163e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.193e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 FTCD-211ENST00000494498 840 ntTSL 318.55■□□□□ 0.561e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 FTCD-206ENST00000460011 1260 ntTSL 1 (best)18.24■□□□□ 0.511e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-207ENST00000578134 831 ntTSL 316.73■□□□□ 0.273e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-213ENST00000579605 560 ntTSL 412.44□□□□□ -0.423e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-222ENST00000581708 543 ntTSL 412.04□□□□□ -0.483e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-212ENST00000579175 867 ntTSL 312□□□□□ -0.493e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-204ENST00000577664 568 ntTSL 410.87□□□□□ -0.673e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-214ENST00000579632 738 ntTSL 410.35□□□□□ -0.753e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-208ENST00000578525 564 ntTSL 49.77□□□□□ -0.853e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-227ENST00000583352 901 ntTSL 39.41□□□□□ -0.93e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CDK5RAP3-220ENST00000581160 490 ntTSL 38.95□□□□□ -0.983e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LNPEP-203ENST00000395784 2075 ntTSL 225.24■■□□□ 1.631e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SNAPC3-203ENST00000421710 730 ntTSL 523.92■■□□□ 1.423e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-211ENST00000559532 678 ntTSL 423.45■■□□□ 1.341e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SNAPC3-206ENST00000490969 2524 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-209ENST00000559130 583 ntTSL 320.46■□□□□ 0.871e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AKAP8-205ENST00000599883 860 ntTSL 519.21■□□□□ 0.671e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.621e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SNAPC3-205ENST00000467062 2574 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.613e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 NDUFB8-208ENST00000531189 577 ntTSL 218.43■□□□□ 0.541e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 NINL-206ENST00000489780 630 ntTSL 318.39■□□□□ 0.531e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 217.99■□□□□ 0.471e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-215ENST00000560763 723 ntTSL 217.81■□□□□ 0.441e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 316.89■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 NDUFB8-209ENST00000531418 585 ntTSL 316.61■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 316.47■□□□□ 0.231e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AKAP8-202ENST00000537303 1350 ntTSL 216.2■□□□□ 0.181e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.2■□□□□ 0.181e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 NDUFB8-207ENST00000529437 602 ntTSL 216.15■□□□□ 0.181e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.13■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-214ENST00000560338 580 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-210ENST00000559249 704 ntTSL 215.58■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 515.27■□□□□ 0.041e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 414.72□□□□□ -0.051e-7■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 214.59□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-203ENST00000558265 872 ntTSL 513.25□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 PAM16-213ENST00000575942 806 ntTSL 312.89□□□□□ -0.351e-7■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 412.12□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.35□□□□□ -0.911e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.051e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RPS7-206ENST00000472966 556 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.321e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CHD4-206ENST00000536999 318 ntTSL 36.21□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-213ENST00000560200 776 ntTSL 55.65□□□□□ -1.51e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 EIF5-218ENST00000561325 569 ntTSL 44.15□□□□□ -1.751e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SLC16A3-204ENST00000578522 535 ntTSL 415.71■□□□□ 0.112e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 F7-204ENST00000473085 558 ntTSL 417.23■□□□□ 0.357e-9■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-214ENST00000576846 1563 nt24.08■■□□□ 1.453e-10■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 SAT2-209ENST00000573930 711 ntTSL 320.03■□□□□ 0.83e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-202ENST00000380466 974 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.193e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-213ENST00000576686 582 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-206ENST00000571195 814 ntTSL 212.68□□□□□ -0.383e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-205ENST00000571074 860 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-207ENST00000572224 669 ntTSL 311.27□□□□□ -0.613e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-208ENST00000573566 640 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.683e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-211ENST00000575826 838 ntTSL 310.49□□□□□ -0.733e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-212ENST00000576579 535 ntTSL 39.91□□□□□ -0.823e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-201ENST00000269298 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SAT2-203ENST00000570850 685 ntTSL 38.44□□□□□ -1.063e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 218.9■□□□□ 0.622e-7■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 314.2□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 AGXT-202ENST00000470255 2638 ntTSL 218.13■□□□□ 0.499e-11■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 224.11■■□□□ 1.452e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 322.87■■□□□ 1.252e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 411.99□□□□□ -0.492e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 411.14□□□□□ -0.632e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.792e-8■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHD9-217ENST00000565832 2169 ntTSL 1 (best)6.27□□□□□ -1.418e-7■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.648e-7■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.928e-7■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.928e-7■□□□□ 10.5
PRPF4O43172 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 10.5
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