Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms