Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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