Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms