Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HNRNPCL3B7ZW38 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms