Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms