Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms