Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC144AA2RUR9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC144AA2RUR9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms