Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms