Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD54BQ9Y620 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms