Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPV2Q9Y5S1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPV2Q9Y5S1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPV2Q9Y5S1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRPV2Q9Y5S1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRPV2Q9Y5S1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRPV2Q9Y5S1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPV2Q9Y5S1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms