Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL27Q9Y4X3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL27Q9Y4X3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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