Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms