Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms