Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAPRE3Q9UPY8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms