Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms