Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MKLN1Q9UL63 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MKLN1Q9UL63 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms