Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms