Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms