Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms