Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms