Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms