Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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