Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms