Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms