Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms