Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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