Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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LHX9Q9NQ69 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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