Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms