Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms