Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms