Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BPESC1Q9GZL8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BPESC1Q9GZL8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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