Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms