Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms