Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms