Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms