Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms