Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms