Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PI4K2AQ9BTU6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms