Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms